A extensão libxml está habilitada por padrão, embora possa ser desabilitada com --without-libxml.
O PHP usa pkg-config para selecionar o arquivos correto de biblioteca e cabeçalhos, e as opções de compilação a serem usadas para libxml2. Para assegurar-se de que a versão pretendida da libxml2 está selecionada, a variável de ambiente PKG_CONFIG_PATH pode ser usada para controlar o caminho de pesquisa para pkg-config antes de executar o script de configuração:
PKG_CONFIG_PATH="/path/to/libxml2/prefix/lib/pkgconfig:/lib/pkgconfig"